Cours BIF7001 (Bioinformatique avancée)

Informations générales.



Actualités.

Le cinquième devoir est en ligne : devoir 5.

Le sixième devoir est en ligne : devoir 6.



Informations pratiques.

Enseignant : Cedric Chauve (Local PK-4625, Tel 4502).

Coordonnateur : Anne Bergeron (Local PK-4320, Tel 8214).

Locaux et horaires : mardi de 14h00 à 17h00 en salle SH-3360.



Fonctionnement du cours.

Ce cours est une continuation du cours BIF7000 (Introduction à la bioinformatique) et sera plus particulièrement axé autour des structures non linéaires (BIF7000 était surtout dédié à l'étude des séquences) : arbres de phylogénie, structures des ARN et des protéines, réseaux (de régulation, métaboliques, ...).

Le but de ce cours est d'aborder les aspects algorithmiques (compréhension théorique des principes sous-tendant les logiciels courants) et logiciels (utilisation des principaux logiciels et programmes disponibles) de ces domaines.



Évaluation.

L'évaluation sera basée sur une série de 6 travaux pratiques, dont les 5 meilleurs seront pris en compte, chacun pour 20% de la note finale.

Plan du cours (Projet).



Bibliographie.



Matériel additionnel.

Quelques ressources logicielles.

Quelques exercices complétant le cours (attention, modifications fréquentes).

Les archives des devoirs :